2026年3月，台湾民众党云林县支部因党中央初选程序争议引发大规模退党事件，约100名成员集体辞去党籍，带头者为前云林县长林淑芬与林景冠兄妹。他们反对党内提名曾因光伏案被判刑议员王优敏之子王俊毅参选县议员，认为此举有失公平，引发内部矛盾激化 [1, 2, 3, 4, 5, 6, 7]。

民众党创党主席柯文哲于2026年6月14日在云林参加党内志工座谈时回应此风波。他将党内成员流动形容为“有序的混乱”，称如同人体皮肤每28天进行新陈代谢，一党若无成员进出就是“化石”，强调“合则来，不合则去”是正常党内动态。他还指出，民众党目前仍保持稳定增长，面对当前局势属于“慢慢成长中偶尔感冒”的阶段 [1, 3, 4, 8, 9, 10, 5, 6, 11, 7]。

柯文哲同时提到，今年在选举周期中，民进党面临的退党人数反而多于民众党，暗示党内波动具有普遍性。他在座谈中还就选举提出忠告，表示“选举很世俗，要靠空战过关不容易”，呼吁候选人须具备自身实力，强调“选举要花钱，不能说连生活都有问题了还要来选，太痛苦了” [1, 2, 3, 4, 8, 9, 10, 12, 11, 7]。

会议当天，柯文哲与民众党主席黄国昌共同出席云林志工论坛，听取基层意见和竞选情况，吸引超过百位候选人及志愿者参与，全力整合地方资源与动员力 [1, 2, 3, 4, 9, 10, 5, 6, 12, 11, 7]。

同日，林景冠宣布重新加入民进党，计划代表该党参选云林县议员，离开民众党阵营，显示内部矛盾已影响成员政治归属选择 [7]。民众党后续将继续推动基层工作与选举部署，努力稳固云林及其他县市的组织力量。